130 竞技场无差别胁迫事件(前篇)
131 竞技场无差别胁迫事件(后篇)
132 魔术爱好者杀人事件(事件篇)
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇)
134 魔术爱好者杀人事件(解决篇)
135 消失的凶器搜索事件
136 青色古堡探索事件(前篇)
137 青色古堡探索事件(后篇)
138 最后上映的杀人事件(前篇)
139 最后上映的杀人事件(后篇)
140 SOS！步美传达的讯息
141 结婚前夜的密室事件(前篇)
142 结婚前夜的密室事件(后篇)
143 疑惑的天体观测
144 上野出发北斗星3号(前篇)
145 上野出发北斗星3号(后篇)
146 本厅刑事恋爱物语(前篇)
147 本厅刑事恋爱物语(后篇)
148 路面电车急刹车事件
149 游乐园蹦极事件
150 汽车爆炸事件的真相(前篇)
151 汽车爆炸事件的真相(后篇)
152 神秘老人失踪事件
153 园子的夏日海滩冒险物语(前篇)
154 园子的夏日海滩冒险物语(后篇)
155 水中的钥匙密室事件
156 本厅刑事恋爱物语2(前篇)
157 本厅刑事恋爱物语2(后篇)
158 沉默的环状线
159 奇怪的五重塔传说(前篇)
160 奇怪的五重塔传说(后篇)
161 流水亭流出的杀意
★162 飞天密室 工藤新一最初的事件☆
163 月与星与太阳的秘密(前篇)
164 月与星与太阳的秘密(后篇)
165 少年侦探队消失事件
166 鸟取县蜘蛛屋的怪事(事件篇)☆
167 鸟取县蜘蛛屋的怪事(疑惑篇)☆
168 鸟取县蜘蛛屋的怪事(解决篇)☆
169 维纳斯之吻
170 黑暗之中的死角(前篇)
171 黑暗之中的死角(后篇)
172 复活的死亡讯息(前篇)
173 复活的死亡讯息(后篇)
2000年（174~218）
★174 二十年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件
175 被杀了四次的男人
176 与黑衣组织的再会(灰原篇)☆
177 与黑衣组织的再会(柯南篇)☆
178 与黑衣组织的再会(解决篇)☆
179 咖啡店货车闯入事件
180 红色杀意的夜想曲(前篇)
181 红色杀意的夜想曲(后篇)
182 九个门大搜索
183 危险的处方笺
★184 诅咒的假面的冷笑☆
185 被狙击的名侦探(前篇)
186 被狙击的名侦探(后篇)
187 回响在黑暗中的的神秘枪声
188 危命的复活 洞窟中的侦探团☆
189 危命的复活 负伤的名侦探
190 危命的复活 第三种选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
194 意味深长的八音盒(前篇)
195 意味深长的八音盒(后篇)
196 看不见的凶器　小兰的初次推理
197 超级汽车杀人事件(前篇)
198 超级汽车杀人事件(后篇)
199 嫌疑犯毛利小五郎(前篇)
200 嫌疑犯毛利小五郎(后篇)
201 第十位乘客(前篇)
202 第十位乘客(后篇)
203 伊卡路斯的黑色之翼(前篇)
204 伊卡路斯的黑色之翼(后篇)
205 本厅刑事恋爱物语3(前篇)
206 本厅刑事恋爱物语3(后篇)
207 无与伦比的推理
★208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒☆
209 龙神山的坠落事件
210 五彩传说的水中宫殿（前篇）
211 五彩传说的水中宫殿（后篇）
212 蘑菇、山熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山熊和侦探队（后篇）
214 怀古饭店的神秘事件
215 复仇海滩(前篇)
216 复仇海滩(后篇)
217 被封印的目暮的秘密(前篇)
218 被封印的目暮的秘密(后篇)
2001年（219~262）
★219 被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德☆
220 满口谎言的委托人(前篇)
221 满口谎言的委托人(后篇)
222 人鱼失踪记(事件篇)☆
223 人鱼失踪记(推理篇)☆
224 人鱼失踪记(解决篇)☆
225 生意兴隆的秘密
226 战斗游戏的陷阱(前篇)
227 战斗游戏的陷阱(后篇)
228 暗藏杀机的陶艺教室(前篇)
229 暗藏杀机的陶艺教室(后篇)
230 谜一样的乘客(前篇)
231 谜一样的乘客(后篇)
232 公寓坠落事件
233 无法消失的证据(前篇)
234 无法消失的证据(后篇)
235 酒窖密室事件
236 南纪白滨的神秘之旅(前篇)
237 南纪白滨的神秘之旅(后篇)
238 大阪的3个K事件(前篇)
239 大阪的3个K事件(后篇)
240 新干线护送事件(前篇)
241 新干线护送事件(后篇)
242 元太少年的灾难
243 毛利小五郎的冒充者(前篇)
244 毛利小五郎的冒充者(后篇)
245 向日葵馆的枪声
246 陷入网中的谜团(前篇)
247 陷入网中的谜团(后篇)
248 治愈之森林的不在场证明
249 偶像们的秘密(前篇)
250 偶像们的秘密(后篇)
251 OK牧场的悲剧
252 图画中的绑架犯
253 本厅刑事恋爱物语4(前篇)

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