较原始的主干爬行动物，是出现于石炭纪晚期的第一批爬行动物之一，也是现代最繁盛爬行动物，包括现存爬行动物的绝大多数成员 。
始鳄目Eosuchia:早期的鳞龙类，是其它双孔类的祖先，也是生存历史最长的爬行动物，在新生代早期尚延续了一段时间 ， 也有人将最早的和最完的类型置于新的目 。
喙头目Rhynchocephalia:原始的鳞龙类，绝大多数生存于中生代，仅有楔齿蜥残存到现代，是现存最原始的爬行动物 。
楔齿蜥科Sphenodontidae:现存最原始的爬行动物，仅2种，分布于新西兰及附近岛屿 。
蜥蜴目Lecertifromes(Sauria):现代爬行动物种最大的一类，多达4000余种，分布遍及世界各地，形态多样 。
鬣蜥亚目Iguania:典型的成员背上有鬣鳞，略似楔齿蜥，均四肢完整 ， 不少种类可以变换身体的颜色 ， 并包括一些相貌最独特的蜥蜴，主要分布于热带、亚热带地区，树栖、陆栖或水栖 。
美洲鬣蜥科Iguanidae:主要分布于新大陆的鬣蜥，种类繁多，最常被分成多达8个不同的科 。
鬣蜥科Agamidae:旧大陆的鬣蜥，在亚洲和大洋洲最丰富，非洲和欧洲较少 ， 而马达加斯加岛没有分布 。
避役科Chamaeleonidae:即变色龙 ， 最独特的蜥蜴，主要分布于非洲特别是马达加斯加岛 ， 少数分布于亚洲和欧洲南部 。
壁虎亚目Gekkota:包括四肢健全的壁虎和四肢退化的鳞脚蜥等，通常眼睛比较大，眼睑不能活动 。
壁虎科Gekkonidae:蜥蜴中的第二大科，遍及世界各地，包括一些人们最熟悉的爬行动物，也有人将其拆成几个不同的科 。
鳞脚蜥科Pygopodidae:分布限于大洋洲，体型似蛇 ， 无前肢，后肢退化成鳞片状 。
夜蜥蜴科Xantusiidae:分类地位不定的蜥蜴，略似壁虎，但也有人将其置于石龙子亚目，分布于美洲 。
双足蜥科Dibamidae:所知甚少的分类地位不定的蜥蜴 ， 有人将其置于石龙子亚目或自成一独立的亚目 ， 仅雄性有短的后肢，眼退化，多穴居，分布于东南亚 。
石龙子亚目Scincomorpha:蜥蜴中的最大一类 ， 多有典型的蜥蜴体型 ， 但也有些四肢退化 。
非洲蜥蜴科Cordylidae:分布于非洲大陆及马达加斯加岛的小科，有些种类有硬的鳞甲，有人将其分成环尾蜥科和板蜥科两个不同的科 。
蜥蜴科Lacertian:旧大陆的陆栖蜥蜴类，以地中海地区为分布中心 ， 也见于欧亚大陆和非洲的其它地区，最北到达北极圈附近 。
美洲蜥蜴科Teiidae:新大陆的蜥蜴类，多路栖，少数水栖 ， 有人将其进一步划分为美洲蜥蜴科和裸眼蜥科两个科 。
【爬行类动物有哪些】